10個步驟，使用AI 以及筆記系統來輔助我閱讀並思考總結多篇學術論文

起因

身為一位醫師，從醫學院讀書的過程中，就習慣了常常必須大量的閱讀文獻，並分析、理解、整理各篇文獻的內容。這個過程極度消耗腦力。

在這個充滿聲光刺激的時代，隨便一個手機通知，就能讓你失去了方向。

進入外科訓練後，要能夠坐下來，專心的消耗大量時間來一次整理多篇文獻，是非常困難的事。常常是零碎的時間片段，做個半小時、一小時，然後下一次又有時間可能已經好幾天以後了…
常見的情況是，下一次回來的時候，什麼都不記得了… 又只好從第一篇參考文獻開始讀。這樣的模式，如果是對於要整理10篇甚至20篇以上的文獻作為論證參考的學術寫作，基本上根本是達不到的。

但這是個最壞的時代，也是個最好的時代！最壞是壞在現在資訊爆炸，雖然資料唾手可得，但是需要花費更大的精力去判斷是否為可用的資料。最好是好在，現在是AI大爆發的時代，有各式各樣的AI輔助我們學習以及工作。

那麼，我們該如何改善我們閱讀文獻的流程（workflow），讓AI 以及筆記系統輔助我們，提升我們的效率跟品質呢？

以下，是我個人的工作流程，僅供大家參考～

10 個工作流程步驟

1. 建立初始任務筆記

目前我偏好先使用Logseq這個軟體，因為搭配後續的文獻筆記好用。
在電腦、平板、手機上都可以同步，不漏掉任何一個idea。

先建立任務的

1. 報告或使用的預定日期 （Logseq 中，使用/ + pick date 就可以快速添加日期）
2. 待辦事項 （在Logseq 中，只要按下cmd+Enter就可以，非常簡單）
3. 核心問題，待回答解決之問題（這是自己認真要思考的一個步驟，每個人的核心問題都會不同，因為認知程度不同，好好設定自己的問題）

以上，都還不會用到AI，只需要筆記系統來幫助自己思考以及記憶。

需要Logseq 使用幫助的，可以參考加入我創立的FB 粉絲團 — Logseq 中文社群 | 免費x卡片盒筆記x知識連結

2. 蒐集reference

• 先從UpToDate、Textbook 開始閱讀已經驗證的精華，再從中找出相關reference原文
• 如果還是有未能解答的問題，則找Pubmed 是否有相關文獻可以解答。
  （額外tips，可以看一下較舊的論文有沒有新的citation article）
• 如果時間不多，建議搭配Perplexity 或是Consensus（AI搜尋網站）直接搜尋，perplexity 會直接列出參考的網址、或是使用ChatGPT來建議搜尋pubmed的關鍵字。（好處是可以先使用自然語言來詢問，再請AI幫忙設定完整的搜尋關鍵字* ）

ChatGPT 對話畫面
Prompt:
請當一位學術研究教授，專精於資料、文獻搜尋，精通uptodate網站、pubmed網站的搜尋技巧
Prompt :
情境：一位車禍受傷的病人，CT發現有主動脈受傷，身為心臟血管外科醫師，我知道他可能需要手術處理，但我不確定手術timing何時最好。
問題：我想要知道什麼樣的治療流程對病人最好？請建議我使用什麼關鍵字來搜尋pubmed
Prompt :
我找到約10篇可能符合我問題的文獻，請問我如何篩選？

• 想辦法找到所有的原文PDF檔案，這邊就要大家自行發揮了😅

1. Pubmed網站，在很多大醫院院內網路會有權限可以下載原文
2. 在其他地方，我很常會使用Sc開頭的網站，來搜尋看看，不要太新的話，成功機會大概8成以上。

3. 把PDF檔案全部放入Zotero 軟體

好處是可以蒐集在一起，電腦、平板同步，自動生成論文資訊，還可以直接閱讀PDF檔，做筆記…

4. 篩選要閱讀的論文

時間不多一定要放棄比較不相關的，只閱讀最相關、最新、最有可信度的論文，閱讀篇數以可以準備的時間多寡以及個人能力來決定。

• 初步篩選：

去除太舊的文章，優先保留新的、大型期刊（IF高的）、引用數高的、RCT、回顧性研究或觀察性研究、guideline…

• 次級篩選：

1. 先看Abstract，這邊我習慣直接複製文字來給AI看，並請他整理成較易閱讀的版面（Markdown格式、有序排列、無序排列、層級…）
2. 看結論是否有清楚回答還是模糊不清，是否是自己要的解答
3. 研究有哪些limitation？是否對象inclusion符合我的病人？

5. 配合AI，加速閱讀及讓理解更簡單

• 搭配AI的技巧

1. 雙開視窗，可以的話，雙螢幕可能更好
2. 文獻PDF檔案放在左側螢幕（最好直立式），右側開AI
3. 不要使用類似ChatPDF這種直接上傳PDF的工具，直接複製文字給AI，加上想要的prompt

• Prompt 建議：

1. → 繁體中文 (翻譯成繁體中文)
2. tldr （就是重點整理的縮寫）
3. use markdown (可配合筆記系統複製貼上)
4. 請解釋給國中程度的一般人聽，使用比喻

6. 搭配筆記系統來思考並建立第二大腦，建立“文獻筆記”

目前還是偏好使用 Logseq 來整理，原因：

1. 簡潔，不會被太多複雜功能阻礙思考
2. 可以使用Markdown
3. 可以Toggle 的 Block，幫助聚焦、專注
4. 可以快速建立雙向連結、複製貼上block編號（連結）、快速引用block或page
5. 大部分都可以使用鍵盤就完成編輯
6. 可以搭配任務筆記

7. 回過頭來編輯“任務筆記”

一開始建立的任務筆記打開，將文獻筆記開在側邊欄備用

• 重新檢視並調整

1. 待辦事項
2. 核心問題，待回答解決之問題

• 接下來開始回答問題

1. 列出前面步驟找到的Ref. 並建立預計閱讀的文獻筆記（直接在標題反白加上雙掛號即可）
2. 將文獻筆記中學習到的內容，回過來回答任務筆記中的問題
3. 記得要將reference 加上 1 的編號 並標示每個回答的出處

重點！！不要陷入以下陷阱

不要想要一次完成所有筆記，設定好每次的工作時間，並在當次工作結束的時候，建立一個“記憶存檔”的block，把目前學會的寫下來，當作要教未來回來，已經什麼都忘光的自己

8. 記憶存檔

在任務筆記中最上方，建立“記憶存檔點”的Block，就像我們打電動，玩到一半會存檔一樣。

• 把自己腦中現在的知識（通常如果上述的步驟有用心、專注執行，現在腦中會很有概念），當作要上課教另一個什麼都不會的聽眾、學生一樣，寫下來。
• 這邊可以使用複製block 連結編號的方式，來引用文獻筆記或任務筆記中的block

9. 請AI 給你反饋

將內容反饋回AI，讓AI模擬聽眾、學生可能會問的問題，並找出自己的盲點

• Prompt 參考

以下為我目前整理好的總結筆記，請扮演一位聽眾，詢問我不懂的問題：【此次的記憶存檔內容….】

10. 輸出

依照第二大腦之內容，建立輸出，PPT、文章、圖片海報…

個人認為，在醫學界，能把PPT做好的人其實不多… 其他領域（行銷、設計、商業… ）都很強調PPT技能，要排版、美圖、設計感、吸引力、動畫…. 但回過頭來想想，醫學界真的需要這樣嗎？

老實說，我個人也曾經花了很多時間在美化自己的PPT，但去學會就發現，其實就是簡潔有力、讓人看得清楚就夠了，大家想要的是你的分析、知識、理念的傳達，而不是要買你的產品。有時候，口說清楚、內容紮實有料還更重要！

所以，我後來覺得應該盡量是花7–8成的時間在製作內容、蒐集知識，最後腦中有一個大綱，再開始製作PPT。

設定好大綱，並把各標題填入空白頁，每個topic盡量搭配圖片、表格、清楚的排版來解釋概念。每個Topic不要花太多張頁面來解釋。（3–5張就很多了，太多張代表每一張的內容不紮實）

為了搭配圖片，有時候會要上網google尋找，但切記要小心智慧財產權的問題～ 現在，我們又能夠再請AI出場了！！ 可以搭配Midjouney或是DALLE來生成建議的示意圖，免費版可以參考使用Bing Image Creator，簡單好用，而且最近還更新了！更加聰明👍

結語

以上，就是我目前的10個步驟，使用AI 以及筆記系統來輔助我閱讀並思考總結多篇學術論文。希望也可以給你一點啟發、幫助😊

現在世界變化很快，不變的就是一直在變。我也會持續優化流程或加入新的工具，但是大腦的思考步驟是不會改變的喔！以後再聊啦～

Bonus

另外，遇到困難或龐大的概念需要理解的時候，我也會使用圖像化的筆記系統 — Heptabase 幫助我喔！